培养目标
掌握马克思主义、毛泽东思想的基本原理，深刻领会邓小平理论“三个代表” 重要思想，坚持四项基本原则，热爱祖国、遵纪守法、坚持真理、献身科学，具备严谨求实的科学态度和优良的职业道德。
具备高度的环境意识和二十一世纪环境保护事业赋予的责任感，在“知识”、“能力”、“做人”三方面，全面发展，成为能够为新世纪我国可持续发展作出贡献的环境保护专门人才。
具备环境科学方面扎实的基础知识及解决实际环境问题的技能和能力；熟悉和了解本专业的发展进程和学术动态；具备独立从事环境科学研究方案设计、污染防治与修复原理技术研究及成果转化的能力。进入本专业的博士研究生应对环境科学与工程一级学科和相关的学科领域有着广泛的了解和系统的专业知识，并且要更加具有创新和独立工作能力。
具备高度综合的、有扎实宽广的环境知识及解决实际环境问题的技能和能力。了解该学科的发展、现实和动态，能独立开展与本学科相关的研究和教学工作。学位论文具有一定的创新性，选题针对具体的环境问题。
掌握一至二门外语，具备良好的国内外学术交流的能力和健康的身体。
学科介绍
南京大学是全国最早开展环境科学研究和教学的单位之一，是江苏省重点学科，是全国首批获得环境科学与工程学科国家一级学科博士学位授权单位之一，设有博士后流动站，并与同济大学共建“污染控制与资源化研究国家重点实验室”。本学科是教育部环境科学教学指导委员会第一届主任单位和第二届副主任单位，是国务院学位委员会环境科学与工程学科评议组成员单位。本学科是南京大学“教育部教育振兴行动计划（985工程）” 重点发展新兴学科之一。
研究方向
1. 环境化学
有机污染化学
无机污染化学
污染防治化学
环境分析化学
污染生态化学
理论环境化学
2. 环境生物学
生态毒理学与风险评价
环境生物技术
环境生物化学
环境遗传毒理学
环境微生物学
生物修复
师资力量
本学科环境化学方向现有教授12人，副教授6人，博导11人。并有多名国内外知名学者担任兼职教授。
科研水平
自1996年以来，本学科点主持了国家、省部等研究课题 72项，其中国家自然科学基金 32项，科研经费共 2700万（包括国际合作项目）。在国内外学术刊物上发表论文476 篇，其中中文核心刊物298篇，外文刊物182篇，SCI源刊物论文 180篇,SCI源论文数在全国环境类单位中名列前茅。出版专著 7部，参编专著 5部，出版教材5本。获国家、省部奖 10项，鉴定成果 15项。开展国际合作项目10项，举办国际和国内学术会议7次。研究成果具有国际和国内学术影响。
招生对象
硕士研究生：具有大学本科文凭及同等学历的应届毕业生和在职人员，参加全国硕士研究生统一考试合格、再经面试合格者。
硕博连读研究生：具有大学本科文凭应届毕业生和在职人员，参加全国硕士研究生统一考试和面试合格者，入学后前二年完成硕士研究生课程学习，通过硕士研究生中期考核合格后，参加全国博士入学考试合格者，经系学术委员会审核和校研究生院批准直接转入博士生学习。
博士研究生：已获硕士学位的应届硕士毕业生和在职人员，经博士生入学考和面试合格者。
学习年限
硕士研究生：二年/三年
硕博连读：五年
博士研究生：三年
在职博士生：三/五年
课程设置
（一）硕士生阶段
A类
科学社会主义理论与实践 (2学分)
自然辩证法 (2学分)
硕士英语 (4学分)
B类
环境科学研究进展 (2学分)
环境工程技术进展 (2学分)
C类
有机污染化学 (2学分)
生物修复技术 (2学分)
仪器分析进展 (2学分)
污染生态化学 (2学分)
环境规划与管理进展 (2学分)
D类
大气污染化学 (2学分)
环境科学高级建模方法 (2学分)
遗传毒理学 (2学分)
环境过程动力学 (2学分)
生态毒理学与环境质量 (2学分)
环境生物无机化学 (2学分)
环境微生物学进展 (2学分)
环境生化毒理学 (2学分)
新型工业分离与技术 (2学分)
精细化工清洁生产工艺技术 (2学分)
当代给水与废水处理原理 (2学分)
第二外语 (2学分)
补修课程：
本科阶段不是环境科学与工程一级学科的学生及在本学科上欠缺本科层次知识的硕士研究生，应根据学校要求在导师指导下补修有关课程，补修不合格者不予毕业。
硕士研究生实行学分制，一般为32个学分，非本科及同等学力入学者为36个学分。
（二）博士生阶段
1、公共基础课
2、专业学位课
有机污染化学进展
环境生态毒理学进展
环境修复
环境基因组学
培养方式
(一) 硕士生培养
建立研究生分流培养的机制，配合多规格多标准的人才培养模式，加强阶段性考核，如中期考核进行评优分流，开题报告或文献综述，选拔培养对象，重点扶持。改变课程考核的单一的考试形式，代之以面试、论文答辩等多种考查方式。
中期考核时间由系考核小组统一规定，不迟于第三学期第十周，基本完成课程学习和开题报告的研究生可向系里提出申请，接受考核。考核小组由本系五位专家组成，另设一名秘书。考核内容包括：
检查是否完成了专业培养方案规定要完成的课程学习，特别是必修课和学位课；
看课程考试成绩、试卷难易程度，看专题报告、文献综述及选题报告的完成情况和学术水平；
毕业论文的选题、研究方案、进度安排、预期成果和可行性；
研究生是否具有独立从事科学研究工作的能力；
考核小组本着公正、负责、实事求是的态度对研究生做出评价。
硕士生学位论文
科学研究是研究生培养的重要组成部分，是培养创新能力的途径，是提高研究生培养质量的关键环节。学位论文的选题应体现本学科领域的前沿性和先进性，要与导师的科研任务相结合，与国家的可持续发展相结合。鼓励研究生在导师指导下，通过阅读文献资料，自主选题。学位论文要有开题报告，进展检查，预答辩等过程，有明确的时间安排。在论文工作期间，研究生至少应在国内核心刊物上发表论文一篇及通过省部级鉴定一项或申请专利一项。
论文在答辩前要请两位在环境工程领域有较深造诣的专家评阅，其中至少有一位是外校专家。论文答辩应由校内外专家组成的答辩委员会主持进行。
（二）硕博连读和直读博士生
选拔办法
由研究生根据中期考核的具体情况，经博士点和导师同意，向研究生院提出申请硕博连读。直博生在研究生入学考试中表现突出者中进行选拔，必须再经过一次综合考核。这两者经资格考核并通过后均可取得博士生资格，享受博士生待遇，由学校作为新录取的博士生上报国家教委备案。
培养方案
第一阶段以课程学习为主，时间一般为一年半，第二阶段以科学研究和撰写博士学位论文为主，时间一般为三年半。直博生课程学习的总分不低于40学分。在课程学习阶段除完成学位课程外，应根据学科拓宽知识面的要求和本人特点，选读5-6门选修课。进入博士论文阶段的半年内要完成开题报告。
（三）博士生的培养方式
入学三个月内，在导师指导下完成个人培养计划。内容包括：研究方向、课程学习、文献阅读、选题报告、科学研究、学术交流、学位论文及实践环节等方面的要求和进度计划。
入学后在导师指导下，查阅文献资料，深入调查研究，确定具体课题一般在1年左右的时间完成开题报告。开题报告应包含文献综述、论文选题及其意义、主要研究内容、工作特色及难点、预期成果及可能的创新点等。开题报告在二级学科或跨部分二级学科范围内进行，由博士导师为主组成的考核小组评审。开题报告应吸收有关导师和研究生参加，跨学科的论文选题应聘请相关学科的导师参加。若学位论文课题有重大变动，应重新作选题报告，以保证课题的前沿性和创新性。评审通过的选题报告，应以书面形式交研究生院备案。
学科综合考试按专业统一组织，考试内容包含基础理论和专业知识两部分，对同专业的博士生试题要有一定比例的共同要求。还要有一定比例的跨二级学科的内容，博士生指导教师负责命题部分一般不超过三分之一。考试由笔试和口试两部分组成。考试内容覆盖3～4门基础理论和专业课，考试委员会应提前1个月通知参加考试的博士生。博士生入学后第二学期末或第三学期初进行学科综合考试。
实行博士生学术报告制度。博士生在论文工作期间每学期至少在二级学科范围内做1次学术报告，在学期间至少有1次在全国性或国际学术会议上宣读自己撰写的学术论文，博士生在学期间应参加8次以上学术报告，其中两次以上为跨二级学科的学术报告。
博士生学位论文
学位论文实行中期检查制度。在研究生学位论文工作的中期按二级学科或跨部分二级学科组织考核小组对研究生的综合能力、论文工作进展状况以及工作态度、精力投入等全方位的考查。通过者，准予继续进行论文工作。论文中期检查可与学术报告统筹安排。
获得学位要求为基础研究A类。
在博士学位论文工作基本完成以后，最迟应于正式申请答辩前3个月，做1次论文工作总结报告。
博士学位论文是博士生培养质量和学术水平的集中反映，应在导师指导下由博士生独立完成。
博士学位论文应是系统完整的学术论文，应在科学上或专门技术上作出创造性的学术成果，应能反映出博士生已经掌握了宽广的基础理论和系统深入的专门知识，具备了独立从事教学或科学研究的能力。
学位论文工作时间一般为2年（选题报告通过之日起至论文评阅前止）以上。
论文在答辩前要请5-7位在环境工程领域有较深造诣的专家评阅，其中至少有二位是外校专家。论文答辩应由校内外专家组成的答辩委员会主持进行。
(四) 学位授予
学位论文通过答辩后，经系学位委员会讨论，上报校学位委员会，经批准可授予中华人民共和国理学硕士或理学博士。